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Die Entwicklung der Informatik und Technologie hat die rasante Entwicklung der globalen Arzneimittelforschung und -entwicklung vorangetrieben. Computergestützte Arzneimitteldesign-Technologie, die Tausende von Molekülen schnell untersucht, spielt eine wichtige Rolle in der Arzneimittelforschung und -entwicklung. Es basiert auf Computerchemie und führt die Optimierung und Gestaltung von Leitverbindungen durch Computersimulation, Berechnung und Budgetierung der Beziehung zwischen Arzneimitteln und Rezeptor-Biomakromolekülen durch. Die Anwendung dieser Technologie in der Erforschung neuer Arzneimittel kann nicht nur die Kosten für die Arzneimittelforschung und -entwicklung senken, sondern auch * * Um die Zeit bis zur Markteinführung neuer Medikamente zu verkürzen, ist computergestütztes Medikamentendesign auf Basis ligandenbasierter Medikamentendesigner eine wichtige Methode. Die bindungskinetischen Eigenschaften von Arzneimittelmolekülen und Zielmolekülen stehen in engem Zusammenhang mit ihrer Wirksamkeit im Körper. Daher liefert molekulares Design, das auf die Verbesserung der kinetischen Bindungseigenschaften ausgerichtet ist, neue Ideen für die Arzneimittelforschung und -entwicklung. Die Konstruktion molekularer Modelle kann Anregungen für nachfolgende Forschungen liefern. Beim ligandenbasierten Arzneimitteldesign wird die Struktur bekannter Liganden analysiert, die an Rezeptoren binden. Dies wird auch als indirektes Arzneimitteldesign bezeichnet und umfasst Pharmakophormodelle und quantitative Struktur-Aktivitäts-Beziehungsmodelle (QSAR). (1) Pharmakophor-Modell Wenn einige Forscher rezeptorbasierte Methoden zum Arzneimitteldesign verwenden, haben sie die Auswahl von Histondeacetylase (HDAC)-Zielproteinen und molekularen Docking-Methoden untersucht und ein zuverlässiges molekulares Docking-Modell etabliert. Das konstruierte Modell wurde gemeinsam zum Screening der Drugbank-Datenbank verwendet und es wurden zwei Kandidatenverbindungen mit neuartigen Gerüsten erhalten. Mittels Molekulardynamik wurde die Wechselwirkung zwischen der Kandidatenverbindung und dem Referenzmolekül TrichostatinA und dem Protein simuliert, und es wurde festgestellt, dass sie alle stabil an HDAC binden können. Unter ihnen hat die Verbindung DB03889 eine höhere Bindungsfähigkeit als TrichostatinA. Diese Studie liefert potenzielle Leitverbindungen für die Entdeckung neuer HDAC-Inhibitoren. Eine Leitverbindung bezieht sich auf eine chemische Struktur mit einer bestimmten biologischen Aktivität. Durch Optimierung der Leitverbindung und strukturelle Transformation und Modifizierung der Leitverbindung kann ein Arzneimittel mit hervorragenden pharmakologischen Wirkungen erhalten werden. Medicilon kann seinen Kunden Arzneimittelentwicklungsdienstleistungen anbieten, die verschiedene Ziele und Krankheitsbereiche abdecken, einschließlich der Entdeckung aktiver Verbindungen, der Zielvalidierung, der Optimierung von Leitverbindungen und der Auswahl präklinischer Arzneimittelkandidaten. Pharmakophor ist eine Sammlung pharmakodynamischer Elemente. Die zur Aufrechterhaltung der Aktivität einer Verbindung erforderlichen Strukturmerkmale können einige gemeinsame Atome, Gene oder chemische Funktionsstrukturen und räumliche Orientierungen dieser Verbindungen in der dreidimensionalen Struktur widerspiegeln. Diese bestimmen häufig die Aktivität von Liganden und können zum Screening von Arzneimitteln verwendet werden, indem die gemeinsamen pharmakodynamischen Eigenschaften bekannter Liganden analysiert werden, die an Rezeptoren binden. Einige Forscher führen beispielsweise computergestütztes Arzneimitteldesign auf Basis von Liganden durch und konstruieren ein Pharmakophormodell für (1,3)-β-D-Glucan-Synthase-Inhibitoren kleiner Moleküle. Die Forscher wählten 6 kleine Moleküle mit unterschiedlichen Strukturen und guter Hemmaktivität aus, um einen Trainingssatz zu bilden, verwendeten den HipHop-Algorithmus im Pharmakophor-Generierungsmodul von Catalyst, um ein Pharmakophor-Modell zu erstellen, und verwendeten die erstellte Decoyset3D-Datenbank zur Bewertung des Pharmakophor-Modells. Die Forschungsergebnisse zeigen, dass dieses Projekt die Konstruktion eines Pharmakophors für GS-Inhibitoren kleiner Moleküle auf der Basis aktiver Liganden durchführt, was eine gewisse richtungsweisende Bedeutung für das Design und die Entdeckung neuer Inhibitoren kleiner Moleküle der GS hat. (2) QSAR-Modell Gegenwärtig hat die krebshemmende Wirkung von Cumarinverbindungen immer mehr Aufmerksamkeit und Forschung auf sich gezogen. Einige Forscher haben den Zusammenhang zwischen der Struktur und der Antikrebsaktivität solcher Verbindungen mithilfe der quantitativen Strukturaktivitätsmethode (QSAR) untersucht und die wichtigen Faktoren analysiert, die die Antikrebsaktivität beeinflussen. Es gibt auch Studien, die die QSAR-Forschung zu Meeressubstanzen nutzen, um molekulare Deskriptoren mit statistischer Signifikanz für die Antitumoraktivität auszusortieren und ihre theoretische Bedeutung zu analysieren, wodurch eine theoretische Grundlage für die Entwicklung neuer Medikamente bereitgestellt und die Synthese neuer Substanzen gesteuert wird. QSAR basiert auf der dreidimensionalen Struktur des Liganden und des Ziels. Basierend auf den Änderungen der intramolekularen Energie und der Energieänderung intermolekularer Wechselwirkungen werden eine Reihe bekannter pharmakologischer physikalisch-chemischer Eigenschaften und dreidimensionaler Strukturparameter in eine quantitative Beziehung gebracht und anschließend optimiert und transformiert. Daher kann QSAR nicht nur die strukturellen Eigenschaften der Ligandenbindung an den Rezeptor simulieren, sondern auch die Aktivität des Arzneimittels vorhersagen. Allerdings analysiert das ligandenbasierte Arzneimitteldesign nur die strukturellen Eigenschaften des Liganden und ignoriert den Einfluss der Rezeptorstruktur auf die Wechselwirkung zwischen dem Arzneimittel und dem Ziel, sodass es häufig zu falsch positiven Ergebnissen kommt. Die Schwierigkeit bei der Definition eines praktischen Pharmakophormodells besteht darin, dass ein Pharmakophormodell nur die wichtigsten Pharmakophorelemente enthält, die für die Zielbindung erforderlich sind. Während des Interaktionsprozesses müssen sich die räumlichen Konformationen von Rezeptoren und Liganden ständig ändern, um die gegenseitige Bindung zu fördern. Darüber hinaus sind Proteine nicht statisch. Ihre Funktionen werden durch ihre innere Dynamik gesteuert. Es ist auch sehr wichtig, ihre dynamischen Eigenschaften zu verstehen. Konstruktion und Anwendungsforschung molekularer Modelle von HDAC- und PP1-Inhibitoren. Konstruktion eines Pharmakophormodells für niedermolekulare Inhibitoren der (1,3)-β-D-Glucan-Synthase.